MacroAPE 1083:CNhs13449 bl f1
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: CNhs13449_bl_f1
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SOX10#MA0442.1 | -2 | 0.00405173 | 1.92863 | 1 | 6 | GGCTCTGTGCTT | CTTTGT | + |
| RUNX1#MA0002.2 | -2 | 0.00521205 | 2.48094 | 1 | 10 | GGCTCTGTGCTT | GTCTGTGGTTT | + |
| REST#MA0138.2 | 0 | 0.0089688 | 4.26915 | 1 | 12 | GGCTCTGTGCTT | GGCGCTGTCCATGGTGCTGAA | - |
| D#MA00445.1 | 0 | 0.0117085 | 5.57327 | 1 | 11 | GGCTCTGTGCTT | TCCATTGTTCT | + |
| REST#MA0138.2 | -1 | 0.0178294 | 8.48678 | 1 | 11 | GGCTCTGTGCTT | GCGCTGTCCATGGTGCTGA | + |
| Sox2#MA0143.1 | -1 | 0.0179861 | 8.5614 | 1 | 11 | GGCTCTGTGCTT | CCTTTGTTATGCAAA | + |
