Personal tools

MacroAPE 1083:HES1 f1

From FANTOM5_SSTAR

Revision as of 13:55, 7 September 2012 by Autoedit (talk | contribs)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search

Full Name: HES1_f1

Motif matrix
POACGT
11.51666666666666774.43333333333332411.66666666666667710.383333333333324
23.96666666666667572.916666666666676315.9833333333333245.133333333333324
30.04.78333333333332413.659.566666666666677
41.0524.7333333333333240.02.2166666666666677
52.56666666666666783.2666666666666768.7513.416666666666677
64.899999999999999520.1833333333333232.91666666666667630.0
70.03.520.4166666666666754.083333333333324
80.58333333333333240.00.027.416666666666675
90.00.028.00.0
101.98333333333333256.649999999999999511.97.466666666666676
111.516666666666667719.5999999999999985.3666666666666761.5166666666666677
121.98333333333333250.933333333333332313.29999999999999911.783333333333324
133.09166666666667576.1259.9758.808333333333323

Sample specificity

The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon


TomTom analysis

<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya


Target_ID

Optimal_offset

p-value

E-value

q-value

Overlap

Query
consensus
Target
consensus

Orientation

h#MA0449.1-15.82066e-060.002770630.0027094110GGGCTCGTGGCGGGGCACGTGCC+
Mycn#MA0104.2-10.0001741010.08287230.054027410GGGCTCGTGGCGGCGCACGTGGC+
Myc#MA0147.1-10.0002535970.1207120.059022410GGGCTCGTGGCGGCGCACGTGGC+
RTG3#MA0376.140.0005096620.2425990.079079513GGGCTCGTGGCGGATATTAGCACGTGCTTAGTC+
HAC1#MA0310.1-30.001529140.7278720.1615778GGGCTCGTGGCGGCACGTGTC-
USF1#MA0093.1-30.002172721.034220.1615777GGGCTCGTGGCGGCACGTGG+
Mycn#MA0104.2-30.002254431.073110.1615776GGGCTCGTGGCGGCACGTG+
PHO4#MA0357.1-20.002299231.094430.1615778GGGCTCGTGGCGGGCACGTGC+
Arnt::Ahr#MA0006.1-30.002429821.156590.1615776GGGCTCGTGGCGGTGCGTG+
MYC::MAX#MA0059.100.002945751.402180.18282611GGGCTCGTGGCGGGAGCACGTGGT+
Arnt#MA0004.1-30.00327651.559610.1906446GGGCTCGTGGCGGCACGTG+
MAX#MA0058.1-20.004097741.950530.21193610GGGCTCGTGGCGGTCACGTGGTC-
Gamyb#MA0034.1-10.005140882.447060.24930210GGGCTCGTGGCGGGGCGGTTGTC-
TYE7#MA0409.1-20.005355772.549350.2493027GGGCTCGTGGCGGTCACGTG-
ceh-22#MA0264.100.006452783.071520.2530911GGGCTCGTGGCGGTTTCAAGTGGT-
MET32#MA0334.1-50.006524593.10570.253097GGGCTCGTGGCGGTGTGGCG-
CBF1#MA0281.1-20.007044133.3530.2623138GGGCTCGTGGCGGTCACGTGC-
TFAP2A#MA0003.1-20.007842543.733050.2777489GGGCTCGTGGCGGCCCCCGGGC-
YGR067C#MA0425.110.008055313.834330.27774813GGGCTCGTGGCGGTGAAAAAGTGGGGT-
MET31#MA0333.1-30.008765084.172180.2914289GGGCTCGTGGCGGGGTGTGGCG+
HIF1A::ARNT#MA0259.1-20.01110415.285560.3365798GGGCTCGTGGCGGGCACGTCC-
Pax4#MA0068.180.01120775.334860.33657913GGGCTCGTGGCGGGGGGGGGGAGTGGAGTATTGGAAATTTTTC-
MBP1#MA0329.1-10.01227635.843540.3497797GGGCTCGTGGCGGTACGCGT-
CREB1#MA0018.1-20.01467396.984760.3903111GGGCTCGTGGCGGCCTGGTGACGTC+
CRZ1#MA0285.1-60.01749218.326230.4492787GGGCTCGTGGCGGGTGGCTTAG-
INSM1#MA0155.100.0178568.499450.44927812GGGCTCGTGGCGGTGTCAGGGGGCG+
id1#MA0120.100.01966699.361460.45008612GGGCTCGTGGCGGTTTTCCTTTTCG+
RREB1#MA0073.130.02029249.659190.45008613GGGCTCGTGGCGGTGGGGGGGGGTGGTTTGGGG-
RSC3#MA0374.1-30.02089459.945770.4500867GGGCTCGTGGCGGCGCGCGG+
YPR022C#MA0436.1-50.02089459.945770.4500867GGGCTCGTGGCGGCGTGGGG-