MacroAPE 1083:AGTCTCAAGTT,motif953
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: AGTCTCAAGTT,motif953,CNhs10616,T:349.0(10.26%),B:3876.2(5.52%),P:1e-27
| Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| vnd#MA0253.1 | -2 | 0.000766442 | 0.364827 | 0.729653 | 9 | AGTCTCAAGTT | TTTCAAGTG | + |
| tin#MA0247.1 | -3 | 0.00190086 | 0.904807 | 0.904807 | 8 | AGTCTCAAGTT | CTCAAGTG | + |
| Six4#MA0204.1 | -1 | 0.010532 | 5.01321 | 1 | 6 | AGTCTCAAGTT | GTATCA | - |
| STAT1#MA0137.1 | 1 | 0.0145448 | 6.92331 | 1 | 11 | AGTCTCAAGTT | CAGTTTCATTTTCC | - |
| ceh-22#MA0264.1 | -2 | 0.0209685 | 9.98099 | 1 | 9 | AGTCTCAAGTT | TTTCAAGTGGT | - |
