Template:SwissregulonMotif: Difference between revisions
From FANTOM5_SSTAR
No edit summary |
No edit summary |
||
(75 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||
Line 1: | Line 1: | ||
<div width=250 style="float:left;"> | |||
recognized by | |||
{{#arraymap:{{{associated_transcription_factors}}}|;|$| | |||
<span> | |||
| [[ | * {{#explode:$|:|2}} ( [[EntrezGene:{{#explode:$|:|1}}]]{{#set:EntrezGene={{#explode:$|:|1}}}} ) | ||
</span> | |||
|}} | |||
< | (data source: {{{datasource}}}) | ||
</div> | |||
</ | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" style="width: | <div style="float:left;"> | ||
<html><img src="/resource_browser/seqlogos/</html>{{{name}}}<html>.png" width=500> </html> | |||
<br> | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" style="width:500px" | |||
! Motif matrix | ! Motif matrix | ||
|- | |- | ||
| < | | <table cellspacing="0" border="1"><tr><td>{{#replace:{{#replace:{{{weight_matrix}}}|;|</td></tr><tr><td>}}|:|</td><td>}}</tr></table> | ||
|} | |} | ||
</div> | </div> | ||
<div style="clear:both;"></div> | |||
== Motif Activities (MARA) on Phase1 data == | |||
<html> | |||
<script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.js"></script> | |||
<script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.threshold.multiple.js"></script> | |||
<script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.axislabels.js"></script> | |||
</html> | |||
{{#if:{{{motif_activities_hg19}}}| | |||
'''hg19''' | |||
{{#motifmaraP1table_hg19:{{{motif_activities_hg19}}}}} | |||
{{MotifActivitiesInMaraPhase1_hg19|{{{motif_activities_hg19}}}}} | |||
}} | |||
---- | |||
{{#if:{{{motif_activities_mm9}}}| | |||
'''mm9''' | |||
{{#motifmaraP1table_mm9:{{{motif_activities_mm9}}}}} | |||
{{MotifActivitiesInMaraPhase1_mm9|{{{motif_activities_mm9}}}}} | |||
}} | |||
== GOStat results on predicted Motif target == | |||
{{ | {{#if: {{#pos:{{{gostat_on_mara_hg19}}}|GO}} | | ||
<table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">hg19</th></tr><tr><td> | |||
<div style="height:300px; overflow-y:scroll; resize:both;"> | |||
{{#motif_gotable:{{{gostat_on_mara_hg19}}}}} | |||
</div></td></tr></table> | |||
}} | }} | ||
{{# | {{#if: {{#pos:{{{gostat_on_mara_mm9}}}|GO}} | | ||
<table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">mm9</th></tr><tr><td> | |||
<div style="height:300px; overflow-y:scroll; resize:both;"> | |||
=== | {{#motif_gotable:{{{gostat_on_mara_mm9}}}}} | ||
{{# | </div></td></tr></table> | ||
}} | }} | ||
<div style="clear:both;"></div> | |||
{{#set:name={{{name}}}}} | |||
{{#arraymap:{{{associated_transcription_factors|}}}|;|x|{{#set:associated_transcription_factors=x}}}} | |||
[[Category:SwissregulonMotif]] | [[Category:SwissregulonMotif]] | ||
[[Category:Motif]] |
Latest revision as of 16:35, 2 October 2013
recognized by
- ( [[EntrezGene:]] )
(data source: {{{datasource}}})
Motif matrix | |
---|---|
|
Motif Activities (MARA) on Phase1 data
hg19
Chart |
---|
Sample of clicked point: |
mm9
Z-value table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Chart |
---|
Sample of clicked point: |