User:Hisa: Difference between revisions
From FANTOM5_SSTAR
No edit summary |
No edit summary |
||
Line 27: | Line 27: | ||
<script type="text/javascript"> | <script type="text/javascript"> | ||
$(document).ready(function() { | $(document).ready(function() { | ||
var motifs = [' | var motifs = ['4-GAAGTRCCCAAGAAA,BestGuess:STAT6/Macrophage-Stat6-ChIP-Seq/Homer(0.635535008220077),T:57.0(1.74%),B:80.1(0.17%),P:1e-30','4-GCAAATCGGA,CNhs11045,BestGuess:NFY{A,B,C}.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.684584926991251),T:546.0(31.02%),B:8708.7(18.96%),P:1e-33','4-GCYTCTYTBTTTTT,CNhs11796,BestGuess:FOXA1:AR/LNCAP-AR-ChIP-Seq/Homer(0.631391267927214),T:2696.0(53.42%),B:19698.2(45.15%),P:1e-31','4-GGGTTAAA,BestGuess:PH0124.1_Obox5_1(0.672618635751901),T:1582.0(44.80%),B:15795.0(34.18%),P:1e-35','4-HCTTHYBCTD,CNhs11948,BestGuess:SPIB.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.717774978553243),T:243.0(7.21%),B:1263.9(2.74%),P:1e-39','4-NTGTTTTTTTKTC,CNhs13238,BestGuess:Cdx2(Homeobox)/mES-Cdx2-ChIP-Seq/Homer(0.720601838754395),T:1131.0(43.60%),B:14362.2(32.67%),P:1e-30','4-SGSTTAWA,CNhs12494,BestGuess:TBP_f1_HM09(0.686915185618861),T:1802.0(44.43%),B:16035.2(35.80%),P:1e-29','4-TAAAAAGACAGC,BestGuess:MA0277.1_AZF1(0.739253201245228),T:1198.0(22.14%),B:6407.5(14.90%),P:1e-39','4-TTAAACCG,BestGuess:MA0218.1_ct(0.736810492124554),T:574.0(29.56%),B:8494.7(18.45%),P:1e-30','4-TTTAAAGCGG,CNhs10647,BestGuess:NANOG_f1_HM09(0.621152689555457),T:1415.0(35.52%),B:11215.6(25.42%),P:1e-44','4-TTYCTCTKCWGMR,CNhs11671,BestGuess:SPIB.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.741062322726526),T:845.0(26.38%),B:8432.1(18.22%),P:1e-29','5-ATTGGGCGG,CNhs13738,BestGuess:TFDP1_f1_HM09(0.691373558847251),T:479.0(25.18%),B:6485.5(13.93%),P:1e-37','5-AWTKGKCGVG,CNhs13826,BestGuess:TFDP1.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.666557766010215),T:319.0(15.23%),B:3397.8(7.34%),P:1e-33','5-CCCGCCTTTA,CNhs13822,BestGuess:TFDP1.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.705738347845898),T:458.0(23.46%),B:6244.2(13.46%),P:1e-32','5-CCGGATTTA,CNhs13826,BestGuess:ELK4_f1_HM09(0.684350736035022),T:1354.0(64.66%),B:23785.4(51.36%),P:1e-34']; | ||
var pval = [1,1,1,1,6.13482e-09,1,1,1,1,1,0.999604,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00708028,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,1,1,0.997015,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999984,1,1,1,0.00816367,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0100364,1,1,0.96714,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999993,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,5.89797e-08,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993238,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0390238,1,1,0.343053,1,1,0.980803,1,1,1,0.999689,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.825871,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997359,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999947,1,1,0.998966,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.911901,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999755,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.000493084,8.77295e-51,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998598,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999987,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999974,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1,1,0.991086,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.906871,1,0.994737,1,0.834479,1,0.997178,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993321,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.05417e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.835013,1,9.23934e-10,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997324,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,0.938664,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.337207,1,1,1,1,1,1,0.999988,1,1,1,0.645058,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999992,1.51362e-09,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.988897,1,0.99984,1,1,1,0.999998,1,1,0.989695,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,9.93892e-06,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.702219,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,6.60378e-15,1.49915e-09,1,1,1,7.26153e-12,1.56756e-07,1,1,0.560302,1,1,0.199247,1.76124e-05,0.99994,1,1,1,2.55112e-06,0.323866,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.42689e-05,1,1,1,0.561362,1,1,1,0.0545097,1,5.60293e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.003232,1,0.999999,1,1,1,1,1.86691e-11,1,1,1,1,0.879851,0.953685,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.606544,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999975,1,1,1,0.999998,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00434176,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.99999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999976,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998762,1,0.303727,1,1,2.07678e-05,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999991,1,2.07441e-34,1,0.957223,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,0.999943,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]; | var pval = [1,1,1,1,6.13482e-09,1,1,1,1,1,0.999604,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00708028,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,1,1,0.997015,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999984,1,1,1,0.00816367,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0100364,1,1,0.96714,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999993,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,5.89797e-08,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993238,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0390238,1,1,0.343053,1,1,0.980803,1,1,1,0.999689,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.825871,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997359,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999947,1,1,0.998966,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.911901,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999755,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.000493084,8.77295e-51,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998598,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999987,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999974,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1,1,0.991086,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.906871,1,0.994737,1,0.834479,1,0.997178,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993321,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.05417e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.835013,1,9.23934e-10,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997324,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,0.938664,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.337207,1,1,1,1,1,1,0.999988,1,1,1,0.645058,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999992,1.51362e-09,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.988897,1,0.99984,1,1,1,0.999998,1,1,0.989695,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,9.93892e-06,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.702219,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,6.60378e-15,1.49915e-09,1,1,1,7.26153e-12,1.56756e-07,1,1,0.560302,1,1,0.199247,1.76124e-05,0.99994,1,1,1,2.55112e-06,0.323866,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.42689e-05,1,1,1,0.561362,1,1,1,0.0545097,1,5.60293e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.003232,1,0.999999,1,1,1,1,1.86691e-11,1,1,1,1,0.879851,0.953685,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.606544,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999975,1,1,1,0.999998,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00434176,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.99999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999976,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998762,1,0.303727,1,1,2.07678e-05,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999991,1,2.07441e-34,1,0.957223,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,0.999943,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]; | ||
var data = []; | var data = []; |
Revision as of 13:59, 8 August 2012
motif without matrices Swissregulon:SRY.p1 Swissregulon:HOX(A,B,D)3.p1
doubled top motif tables CNhs10855 & CNhs11062 CNhs11245 & CNhs11183 CNhs11248 & CNhs11185 CNhs11772 & CNhs12996 CNhs11781 & CNhs12997
enrichment analysis
20120808135909 yes
20241223054023
{{#sparql: SELECT * WHERE { ?x ?y ?z FILTER regex(?z, "GO") } LIMIT 10 |endpoint=http://go.bio2rdf.org/sparql/ |footer=NO }}